许多人将巴布新几内亚的咖啡与印度尼西亚的相提并论，不过这并不公平。巴布新几内亚位于新几内亚岛东部，与相邻的巴布亚在咖啡的生产上差异甚大。
岛上的咖啡生产历史并不长。虽然咖啡种植早在19世纪90年代便开始了，但最初并未被视为商业产品。到了1926年，18座庄园成立，当时使用的是牙买加蓝山咖啡的种子。到了1928年，咖啡产业才开始蓬勃发展。
20世纪50年代，产业开始有了结构性发展，随着基础设施的兴建,岛上的咖啡相关活动得以蓬勃发展。另一波更长足的发展则出现20世纪70年代，原因可能在于巴西咖啡产量下滑。那时政府有一系列的补助方案鼓励小型农场改由共同合作社经营。业界当时多半着重于庄园的管理，但自20世纪80年代起，当地产业结构开始改变，重心也出现分散的情况。或许因为咖啡价格下跌，使许多庄园因此陷入财务危机。相较之下，小农户受市场波动的影响较小，因此得以继续生产咖啡。
如今岛上95%的生产者皆为自给自足的小农户，生产全国90%的咖啡，品种几乎全数为阿拉比卡。这也表示境内相当大比例的人口都与生产咖啡有关；尤其是居住在高地区域的人们。这点对生产大量高质量咖啡来说是个极大挑战，因为许多生产者缺乏使用恰当的采收后处理的渠道。缺乏产销履历，也使高质量咖啡无法得到应有的奖励。
分级
外销的咖啡豆以质量做分级，等级由高至低分别为：AA、A、X、PSC与Y。前三者授予庄园咖啡名称；后两者则为小农咖啡，其中PSC是优质小农咖啡的缩写（Premium Smallholder Coffee）。
